14. detsembril 2020 teatas ÜhendkuningriikSARS-CoV-2 probleemne variant (VOC), põlvnemine B.1.1.7,viidatud ka kui VOC 202012/01 või 20I/501Y.V1.*Variant B.1.1.7 tekkis hinnanguliselt septembris2020 ja on kiiresti muutunud domineerivaks ringlevaksSARS-CoV-2 variant Inglismaal (1).B.1.1.7 on olnudtuvastatud enam kui 30 riigis, sealhulgas Ameerika Ühendriikides.Nagu13. jaanuaril 2021 on ligikaudu 76 B.1.1.7 juhtumittuvastatud 12 USA osariigis.Mitu rida tõendeidnäitavad, et B.1.1.7 edastatakse tõhusamalt kui onmuud SARS-CoV-2 variandid (1–3).Modelleeritud trajektoorsee variant USA-s kasvab kiiresti 2021. aasta alguses,märtsis valdavaks variandiks.SuurenenudSARS-CoV-2 levik võib ohustada pingelist tervishoiuteenustressursse, vajavad pikemat ja rangemat rakendamistrahvatervise strateegiatest (4) ja suurendada nende osakaalupandeemia tõrjeks vajalik elanikkonna immuunsus.Võtminemeetmed leviku vähendamiseks praegu võivad vähendada potentsiaalivaktsiini B.1.1.7 mõju ja anda kriitilise aja jooksul vaktsiini suurendamisekskatvus.Ühiselt tõhustatud genoomne järelevalvekoos tõhusa avalikkuse pideva järgimisegatervisekaitsemeetmed, sealhulgas vaktsineerimine, füüsiline distantseerumine,maskide kasutamine, kätehügieen ning isoleerimine ja karantiin, taheviiruse SARS-CoV-2 leviku piiramiseksmis põhjustab koroonaviirushaigust 2019 (COVID-19).Strateegilinesümptomiteta, kuid suurema riskiga isikute testimineinfektsioonid, näiteks need, kes on kokku puutunud SARS-CoV-2-ga või kellel onsagedast vältimatut kontakti avalikkusega, annab teisevõimalus piirata jätkuvat levikut.

Ülemaailmne genoomseire ja kiire avatud lähtekoodiga jagamineviiruse genoomi järjestuste uurimine on hõlbustanud peaaegu reaalajasareneva SARS-CoV-2 tuvastamine, võrdlemine ja jälgiminevariandid, mis võivad teavitada rahvatervise jõupingutusi selle kontrolli all hoidmisekspandeemia.Kusjuures mõned mutatsioonid viiruse genoomisesile kerkida ja siis taanduda, võivad teised anda valikulise edasiminekuvariandile, sealhulgas täiustatud ülekandevõimele, nii etselline variant võib kiiresti domineerida teistes ringlevates variantides.

Pandeemia alguses, SARS-CoV-2 variandid, mis sisaldavadD614G mutatsioon spike (S) valgus, mis suurenebretseptoriga seondumise aviidsus sai paljudes kiiresti domineerivaksgeograafilised piirkonnad (5,6).2020. aasta hilissügisel teatasid mitmed riigid tuvastamisestSARS-CoV-2 variandid, mis levivad tõhusamalt.Lisaksvariandile B.1.1.7 on tähelepanuväärsed variandid B.1.351põlvnemine avastati esmakordselt Lõuna-Aafrikas ja hiljuti tuvastatiB.1.1.28 alamklaad (ümbernimetatud“P.1”) tuvastati neljal reisijalBrasiiliast rutiinse sõeluuringu ajal Hanedas (Tokyo)lennujaam.§ Need variandid kannavad geneetilise muta tähtkujukaasa arvatud S-valgu retseptorit siduvas domeenis,mis on oluline peremeesrakuga seondumiseks angiotensiin-ensüüm-2 (ACE-2) retseptori konverteerimine viiruse hõlbustamisekssisenemine.Tõendid näitavad, et neis leiti muid mutatsioonevariandid võivad mitte ainult suurendada ülekandevõimet, vaidvõib mõjutada ka mõne diagnostika toimivust reaalajaspöördtranskriptsioon–polümeraasi ahelreaktsioon (RT-PCR)analüüsid¶ ja vähendada vastuvõtlikkust neutraliseerivate antikehade suhtes(2,3,5–10).Hiljutine juhtumiaruanne dokumenteeris esimese juhtumiSARS-CoV-2 uuesti nakatumine Brasiilias SARS-CoV-2 variandigamis sisaldas mutatsiooni E484K,** mis on näidatudneutraliseerimise vähendamiseks taastuvate seerumite ja monoklonaalseteantikehad (9,10).

See aruanne keskendub variandi B.1.1.7 tekkimiseleAmeerika Ühendriikides.12. jaanuari 2021 seisuga ei ole kaB.1.351 ega P.1 variante pole leitudÜhendriigid.Lisateavet tekkiva SARS-CoV-2 kohtamurettekitavatele variantidele, haldab CDC veebilehteteabe pakkumine tekkivate SARS-CoV-2 variantide kohta.††

 B.1.1.7 põlvnemine (20I/501Y.V1)

Variant B.1.1.7 kannab mutatsiooni S-valgus(N501Y), mis mõjutab retseptoriga seondumise konformatsioonidomeeni.Sellel variandil on 13 muud B.1.1.7 liini määravat mutatsiooni (tabel), millest mitmed on S-valgus,sealhulgas deletsioon positsioonides 69 ja 70 (del69–70) seearenes spontaanselt välja teistes SARS-CoV-2 variantides ja onoletati, et see suurendab transmissiivsust (2,7).Kustutaminepositsioonides 69 ja 70 põhjustab S-geeni sihtmärgi ebaõnnestumise (SGTF)vähemalt ühes RT-PCR-is–põhinev diagnostiline test (st koosThermoFisher Taq Path COVID-19 test, B.1.1.7 variant ja muud variandid koos del69-ga–70 toodavad negatiivsettulemus S-geeni sihtmärgi jaoks ja positiivne tulemus kahe ülejäänud puhuleesmärgid);SGTF on olnud Ühendkuningriigis volitatud esindajaB.1.1.7 juhtumite tuvastamiseks (1).Mitmed tõendid näitavad, et B.1.1.7 on rohkemedastatakse tõhusalt võrreldes teiste SARS-CoV-2-gaÜhendkuningriigis ringlevad variandid.Ühendkuningriigi piirkonnadsuuremal osal B.1.1.7 järjestustest oli epideemia kiiremSGTF-i diagnooside arv sagenes kui teistes piirkondadeskiiremini kui mitte-SGTF-i diagnoosid samades piirkondades, ja asuurem osa kontaktisikutest oli nakatunud indeksihaigete pooltB.1.1.7 infektsioonidega kui nakatunud indekspatsientide puhulmuud variandid (1,3).Variant B.1.1.7 võib suurendada USA panustdeemiline trajektoor lähikuudel.Selle efekti illustreerimisekstöötati välja lihtne kahe variandiga kambriline mudel.USA praegune B.1.1.7 levimus kõigi ringlevate seasviirused on teadmata, kuid arvatakse olevat <0,5%piiratud arv avastatud juhtumeid ja SGTF-i andmed (8).Sestmudelis sisaldasid esialgsed eeldused B.1.1.7 levimust0,5% kõigist infektsioonidest, SARS-CoV-2 immuunsus alateseelnev nakatumine 10%–30%, ajas muutuv sigiminearv (R t ) 1,1 (leevendatud, kuid suurenev ülekanne)või 0,9 (kahanev levik) praeguste variantide puhul ja teatatud esinemissageduseks on 60 juhtu 100 000 inimese kohta päevas1. jaanuar 2021. Need eeldused ei kajasta täpseltmis tahes USA asukohta, vaid viitavad pigem üldistuselekogu riigis levinud tingimused.R t muutus läbiomandatud immuunsusest tulenev aeg ja preva suurenemineLents B.1.1.7, modelleeriti, eeldades B.1.1.7 Rtolema konstant, mis on 1,5-kordne vooluvariantide R t, mis põhinebÜhendkuningriigi esialgsed hinnangud (1,3).Järgmisena modelleeriti vaktsineerimise võimalikku mõjueeldades, et inimese kohta manustati 1 miljon vaktsiiniannustpäev alates 1. jaanuarist 2021 ja et 95% puutumatussaavutati 14 päeva pärast 2 annuse manustamist.Täpsemaltimmuunsus nakkuse vastu kas praeguste variantide võiEeldati B.1.1.7 varianti, kuigi tõhusust jainfektsioonivastase kaitse kestus on ebakindel,sest need ei olnud kliiniliste uuringute esmane tulemusnäitajaesialgsete vaktsiinide jaoks.Selles mudelis on B.1.1.7 levimus esialgu madal, kuid siiski seetõttusee on ülekantavam kui praegused variandidkiire kasv 2021. aasta alguses, muutudes valdavaks variikssipelgas märtsis (joonis 1).Kas voolu edastaminevariantide arv kasvab (esialgne R t = 1,1) või väheneb aeglaselt(esialgne R t = 0,9) jaanuaris toob B.1.1.7 kaasa olulise muutuseülekandetrajektooril ja eksponentsiaalse uue faasikasvu.Vaktsineerimisega, mis kaitseb nakkuse eest,varajase epideemia trajektoorid ei muutu ja B.1.1.7 levibikka esineb (joonis 2).Kuid pärast seda, kui B.1.1.7 muutubdomineeriv variant, vähenes selle ülekanne oluliselt.Vaktsineerimise mõju leviku vähendamisele lähisteltähtaeg oli suurim stsenaariumi korral, mille puhul edastamine toimusjuba vähenemas (esialgne R t = 0,9) (joonis 2).Varased pingutused, etvõib piirata B.1.1.7 variandi levikut, nagu universaalne jarahvatervise leevendamise strateegiate parem järgimine,annab rohkem aega pidevale vaktsineerimisele, et saavutada kõrgemelanikkonna tasemel immuunsus.

Arutelu

Praegu ei ole kliinilistes tulemustes teadaolevaid erinevusiseotud kirjeldatud SARS-CoV-2 variantidega;Kuid,suurem edastusmäär toob kaasa rohkem juhtumeid, mis suurenebinimeste arv, kes vajavad kliinilist abi, ägenemineniigi pingelise tervishoiusüsteemi koormuse vähendamine,ja tulemuseks on rohkem surmajuhtumeid.Jätkuv genoomne jälgiminetuvastada B.1.1.7 juhtumeid, samuti muudeUSA-s murettekitavad variandid on olulineCovid-19 rahvatervise vastus.Kusjuures SGTF tulemusedvõib aidata tuvastada võimalikke B.1.1.7 juhtumeid, mida saab kinnitadajärjestamise teel, tuvastades prioriteetsed variandid, mis ei ilmuSGTF tugineb eranditult järjestuspõhisele jälgimisele.